1990

Amtrak在Northeast Corridor地区内运营的所有机车上完成自动列车控制安装工作。

在North Carolina州的财政支持下，Amtrak开通从New York到Charlotte的 Carolinian号列车。

1991

Caltrans与Amtrak在San Jose与Sacramento之间开通Capitol Corridor列车服务。该服务快速增长，并扩展至Auburn, California。

历时三年，耗资$7500万后，Amtrak重新开放Philadelphia古典艺术风格30th Street车站。在New York City，其与New York州合作建成Empire Connection后，在Penn车站整合所有列车服务，进一步提升效率。

1992

Amtrak与Metra联合完成Chicago Union车站耗资$3200万的装修工程，包括清除大会堂天窗上于二战时期遗留下来的黑漆。

Amtrak收到20台新柴油P32-8BWH机车，该机车采用首批新一代GE制造发动机。

1993

Amtrak收到的22台P40 机车采用Amtrak自己的工业工程师的规格设计，以提高燃油效率、安全性和美观性。

1994

Amtrak完成了New York Penn车站控制中心现代化的一期工程，用新技术取代1910年代技术，以实现更高的运营效率。

1995

Amtrak上线Amtrak.com，步入因特网时代。该网站提供Amtrak服务的相关信息，两年后推出网上订票功能。

赏秋游客和滑雪爱好者庆祝Vermonter列车的开通。在Vermont州的财政支持下，该列车为乘客提供从Washington, D.C.到St. Albans, Vermont之间的铁路服务。

1996

在历史性的一月暴风雪之后，Amtrak是唯一在Northeast继续运营的跨城市列车服务。

在Vermont州的财政支持下，Amtrak开通了Ethan Allen Express，40多年来首次在New York和Rutland, VT之间提供直达列车服务。

1997

Amtrak验收111台全新P42 柴油机车。这些更轻的，更多利用空气动力学的引擎提高了燃油效率，同时，也比早期的模型有更大的马力。

Amtrak往返于Washington D.C.和New York City之间的热门Metroliner服务创下了2,081,326的客流量记录，比上一记录的客流量增加了20,000。

1998

Amtrak与九个州合作，提出Midwest Regional铁路倡议，即为该地区开发一条3,000英里的高速铁路系统，这将极大提升服务水平，减少乘车时间。 

得益于Washington州交通开发局和Oregon州交通开发局的合作资金支持，在Eugene-Portland-Seattle-Vancouver, B.C.走廊的所有运营列车上介绍“Amtrak Cascades”品牌宣传。 

1999

在Oklahoma州的财政支持下，Amtrak重新在Heartland Flyer上介绍Oklahoma City和Fort Worth之间的每日乘客服务。

经过“Capstone”项目中翻新的Amfleet汽车舒适度升级，配备符合美国残疾人法的设施和车厢。